入菲律宾群岛腹地，一路猛轰菲律宾港口城镇。
在南海，西班牙人和荷兰人爆发了两场海战，第一次打了五天时间，西班牙战沉一艘巡航舰，荷兰海军被重创一艘巡航舰，算是荷兰人占了便宜。第二场海战发生在三天后。菲律宾舰队觉得被荷兰人打沉一艘战舰很没面子，于是弗朗西斯科少将带队偷袭荷兰东印度舰队，偷袭成功，击沉三艘荷兰舰队的巡航舰，但自己却付出了两艘巡航舰战沉。
荷兰东印度舰队司令官雷约兹少将因为弹药消耗剧烈缘故，放弃了追击菲律宾舰队的想法，返航巴达维亚补给弹药。
而弗朗西斯科率领菲律宾舰队返航马尼拉后，得知另外一支荷兰舰队正在到处攻击菲律宾港口城镇，于是急忙补给一下后便出击荷兰舰队。
第二支荷兰舰队以轰击菲律宾港口城镇设施为目的，不打算跟西班牙舰队交手，因此打一枪换一个地方。
而菲律宾偏偏岛屿众多，大小好几万个，在消息严重落后的时代里。双方舰队即使在一个小岛的两侧都看不到对方的影子，寻找起来实在太难。
就这样，在后来的两个月时间里，荷兰舰队不断的袭扰菲律宾各个港口城镇，而菲律宾舰队便跟着屁股追击，寻找敌舰队战斗。双方偶尔碰到，但是真正爆发战斗只有两次，而且都是双方都没有太多准备的时候碰上的，因此双方都不由自主的打一会儿后就脱离战斗。
三个月时间，双方只爆发了六场勉强算是海战的战斗，互有伤亡和损失，但总体上势均力敌。
不过，随着荷兰东印度公司渐渐摸清了菲律宾舰队的作战能力之后，雷约兹少将便把两支舰队合并到了一起，向菲律宾舰队挑战。
荷兰东印度公司拥有主力巡航舰一百多艘，被击沉了五艘，重创两艘，还剩下九十三艘。而菲律宾舰队有六十艘主力巡航舰，被击沉了四艘，重创四艘，还剩下五十二艘。
相比较而言，荷兰东印度舰队的巡航舰当中，还有十艘配备了五十门炮的准战列舰。
到了十月初时，荷兰东印度舰队拧成一团寻找菲律宾舰队进行主力决战，这时菲律宾总督费尔南多害怕了起来，担心舰队不保，于是命令菲律宾舰队只能在马尼拉附近游弋，一旦碰上荷兰人的舰队，立刻后退，依托海岸炮加以协助。
这样一来，菲律宾舰队便失去了战略主动性，转主动为被动。反过来，荷兰东印度舰队在雷约兹的指挥下，开始肆无忌惮的袭击菲律宾各个港口城镇，打击菲律宾贸易，增加菲律宾当地人的恐惧，意图迫使菲律宾总督停止战争。
显然，菲律宾总督是不会接受停战条件的。先不说他丢了两千多万元的财政拨款，单单是为他自己也得打，因为宝船队的货船中运了很多属于他的
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